«Я до сих пор не понимаю, для чего нужна функция Prune, не мог бы кто-то объяснить?»  
Pruning позволяет хранить резервные копии гибко и организованно. Обычно со временем интервал между нужными копиями увеличивается.  

Например, допустим, у вас есть ВМ, которую нужно бэкапить каждый день, и нужно сохранять копии в течение 5 лет. Хранить 1825 отдельных копий — не самое эффективное решение. Вместо этого можно сделать так:  
- Одна свежая резервная копия, созданная вручную, например перед обновлением (keep-last: 1).  
- По одной копии на каждый день за последнюю неделю (keep-daily: 7), чтобы при потере данных была возможность восстановить свежую версию системы.  
- По одной копии в неделю за последние 4 недели (keep-weekly: 4), что будет «достаточно», если вдруг понадобится более старая версия машины (например, проблемы после недавнего обновления ПО).  
- По одной копии в месяц за последний год (keep-monthly: 11). За этот период могли быть серьёзные изменения в софте, и может понадобиться проверить, когда появились ошибки или получить доступ к старой удалённой базе данных.  
- Одна копия в год за последние 5 лет (keep-yearly: 4) — для архивации старых данных, например, по юридическим требованиям.  

Pruning позволяет автоматически настроить такое расписание хранения. Нужно всего лишь задать свои параметры, и Proxmox Backup Server будет управлять копиями за вас.