Столкнулся с той же проблемой, что и Даниэль. Это меняет поведение, но приводит, по крайней мере, к другой ошибке:  
Код: Генерация ключа аккаунта ACME...  
Регистрация аккаунта ACME...  

ОШИБКА ЗАДАЧИ: Регистрация не удалась: Ошибка: GET запрос к https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/directory 'acme-ACCOUNT-NAME'-locked команда превысила время ожидания — прерывание.  

URL разрешается и доступен на хосте pve:  
Код: root@pve01:~# curl https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/directory  
{  
 "9Vi9z8_KohI": "https://community.letsencrypt.org/t/adding-random-entries-to-the-directory/33417",  
 "keyChange": "https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/acme/key-change",  
 "meta": {  
   "caaIdentities": [
     "letsencrypt.org"  
   ],  
   "profiles": {  
     "classic": "https://letsencrypt.org/docs/profiles#classic",  
     "shortlived": "https://letsencrypt.org/docs/profiles#shortlived (пока не доступен для общего пользования)",  
     "tlsserver": "https://letsencrypt.org/docs/profiles#tlsserver"  
   },  
   "termsOfService": "https://letsencrypt.org/documents/LE-SA-v1.5-February-24-2025.pdf",  
   "website": "https://letsencrypt.org/docs/staging-environment/"  
 },  
 "newAccount": "https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/acme/new-acct",  
 "newNonce": "https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/acme/new-nonce",  
 "newOrder": "https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/acme/new-order",  
 "renewalInfo": "https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/acme/renewal-info",  
 "revokeCert": "https://acme-staging-v02.api.letsencrypt.org/acme/revoke-cert"  
}

Только что обновились до PVE 9.0.10 на всех хостах (частично потому, что процесс с сертификатами и в предыдущей версии не работал), и теперь у нас та же самая ошибка. Использование переключателя --directory меняет ошибку на «неавторизован», как и упоминал @shapez0r. Завтра попробуем обход с помощью certbot напрямую.

Отлично слышать! Тем не менее, хотелось бы вернуть функционал native обратно.

Грязный хак:  
* закомментируйте (то есть добавьте # в начале) все строки, содержащие код: my $term = Term::ReadLine->new('pvenode');  
* добавьте эту строку кода: my $term = Term::ReadLine->new('pvenode'); на 98-й строке (сразу после этой строки: my ($param) = @_; )  

И вот команда pvenode acme account register внезапно начинает работать.